PATENTY

  • Caban M, Strapagiel D, Bartosz G, Stączek P, Ciesielska A, Gadzalski M, et al., inventors; Univeristy of Lodz, assignee. The method of identifying pathogenic fungus species contained in a sample taken from a patient. Poland patent P. 408 734. 2018.
     
  • Strapagiel D, Slomka M, Majewska M, Janik K, Sobalska M, Bartosz G, inventors; University of Lodz, assignee. Method for determination of gender Poland patent P. 406 569. 2019.
     
  • Strapagiel D, Slomka M, Majewska M, Janik K, Sobalska M, Bartosz G, inventors; University of Lodz, assignee. Method for determination of gender Poland patent P. 423 420. 2019
     
  • Strapagiel D, Siewierska-Górska A, Bartosz G, Żądzińska E, Sitek A, inventors; University of Lodz, assignee. Method and a set for the detection of genetic predisposition to having a certain hair colour. Poland patent P. 403 360. 2013.

ARTYKUŁY - CZASOPISMA RECENZOWANE

  • Mamos T, Grabowski M, Rewicz T, Bojko J, Strapagiel D, Burzyński A. Mitochondrial Genomes, Phylogenetic Associations, and SNP Recovery for the Key Invasive Ponto-Caspian Amphipods in Europe. Int J Mol Sci. 2021 Sep 24;22(19):10300. doi: 10.3390/ijms221910300. PMID: 34638649; PMCID: PMC8509019.
     
  • Krekora-Zając Dorota, Marciniak Błażej, Pawlikowski Jakub, Recommendations for Creating Codes of Conduct for Processing Personal Data in Biobanking Based on the GDPR art.40, Frontiers in Genetics 2021, 12, https://doi.org/10.3389/fgene.2021.711614
     
  • Górska A, Jabłońska E, Reszka E, Niedoszytko M, Lange M, Gruchała-Niedoszytko M, Jarczak J, Strapagiel D, Górska-Ponikowska M, Bastian P, Pelikant-Małecka I, Kalinowski L, Nedoszytko B. DNA methylation profile in patients with indolent systemic mastocytosis. Clin Transl Allergy. 2021 Nov 2;11(9):e12074. doi: 10.1002/clt2.12074. PMID: 34754417; PMCID: PMC8561632.
     
  • Bekier, A.; Kawka, M.; Lach, J.; Dziadek, J.; Paneth, A.; Gatkowska, J.; Dzitko, K.; Dziadek, B. Imidazole-Thiosemicarbazide Derivatives as Potent Anti-Mycobacterium tuberculosisCompounds with Antibiofilm Activity. Cells 202110, 3476. https://doi.org/10.3390/cells10123476
     
  • Bacela-Spychalska K, Taugbøl A, Babik W, Pabijan M, Strand D, Vralstad T, Janik-Superson K, Strapagiel D, Tonczyk G, Baranowska M, Sniegula S (2021) The ecology of ponds in the context of human activity and geography – environmental DNA and beyond. ARPHA Conference Abstracts 4: e64950. https://doi.org/10.3897/aca.4.e64950
     
  • Lach, J.; Jęcz, P.; Strapagiel, D.; Matera-Witkiewicz, A.; Stączek, P. The Methods of Digging for “Gold” within the Salt: Characterization of Halophilic Prokaryotes and Identification of Their Valuable Biological Products Using Sequencing and Genome Mining Tools. Genes2021, 12, 1756. https://doi.org/10.3390/genes12111756
     
  • Martyna Wojtala, Dorota Rybaczek, Ewelina Wielgus, Marta Sobalska-Kwapis, Dominik Strapagiel, Aneta Balcerczyk „The Role of Lysine-Specific Demethylase 1 (LSD1) in Shaping the Endothelial Inflammatory Response Cell Physiol Biochem 2021;55:569-589 https://doi.org/10.33594/000000436
     
  • Urbańska D, Puchała R, Jarczak J, Czopowicz M, Kaba J, Horbańczuk K, Bagnicka E.
    Does Small Ruminant Lentivirus Infection in Goats Predispose to Bacterial Infection of the Mammary Gland? A Preliminary Study. Animals (Basel). 2021 Jun 22;11(7):1851. doi: 10.3390/ani11071851.
     
  • Purzycka-Bohdan D, Kisielnicka A, Bohdan M, Szczerkowska-Dobosz A, Sobalska-Kwapis M, Nedoszytko B, Nowicki RJ. Analysis of the Potential Genetic Links between Psoriasis and Cardiovascular Risk Factors. Int J Mol Sci. 2021 Aug 23;22(16):9063. doi: 10.3390/ijms22169063
     
  • Wajda A., Walczuk E., Stypińska B., Lach J., Yermakovich D., Sivitskaya L., Romanowska-Próchnicka K., Wysocki T., Jarończyk M., Paradowska-Gorycka A. AHR-dependent genes and response to MTX therapy in rheumatoid arthritis patients. Pharmacogenomics Journal, 2021 https://doi.org/10.1038/s41397-021-00238-4
     
  • Katarzyna Molińska, Marta Latek, Błażej Rychlik, Jakub Lach, Dominik Strapagiel, Joanna Majak, Łukasz Błażowski, Joanna Jerzyńska, Piotr Kuna, Pawel Majak, House dust mite sensitization and frequent antibiotic courses may suppress remission of rhinosinusitis and asthma symptoms in young children, Allergy, 10.1111/all.15085, (2021).DOI: 1111/all.15085
     
  • Shindiapina P, Pietrzak M, Seweryn M, McLaughlin E, Zhang X, Makowski M, Ahmed EH, Schlotter S, Pearson R, Kitzler R, Mozhenkova A, Le-Rademacher J, Little RF, Akpek G, Ayala E, Devine SM, Kaplan LD, Noy A, Popat UR, Hsu JW, Morris LE, Mendizabal AM, Krishnan A, Wachsman W, Williams N, Sharma N, Hofmeister CC, Forman SJ, Navarro WH, Alvarnas JC, Ambinder RF, Lozanski G and Baiocchi RA (2021) Immune Recovery Following Autologous Hematopoietic Stem Cell Transplantation in HIV-Related Lymphoma Patients on the BMT CTN 0803/AMC 071 Trial. Front. Immunol. 12:700045. doi: 10.3389/fimmu.2021.700045
     
  • Paulina Pruszkowska-Przybylska, Aneta Sitek, Iwona Rosset, Marta Sobalska-KwapisMarcin SłomkaDominik Strapagiel, Elżbieta Żądzińska, Niels Morling.” Cortisol concentration affects fat and muscle mass among Polish children aged 6-13 years” BMC Pediatrics2021 Vol. 21 Iss. 1 https://doi.org/10.1186/s12887-021-02837-3
     
  • Koj, N., Grochowalski, Ł., Jarczak, J., Wojtowicz, W., Sobalska-Kwapis, M., Słomka, M., Marciniak, B., STrapagiel, D. „The association between polymorphisms near TMEM18 and the risk of obesity: a meta-analysis”. BMC Med Genomics 14, 179 (2021). https://doi.org/10.1186/s12920-021-01025-7
     
  • Pawełczyk, J., Brzostek, A., Minias, A., Płocińśki, P., Rumijowska-Galewicz, ., Strapagiel, D., Zakrzewska-Czerwińska, J., Dziadek, J. “Cholesterol-dependent transcriptome remodeling reveals new insight into the contribution of cholesterol to Mycobacterium tuberculosis pathogenesis”. Sci Rep 11, 12396 (2021). doi.org/10.1038/s41598-021-91812-0
     
  • Ruszkiewicz-Michalska, M.; Kozłowska, M.; Wilk, M.; Janik-Superson, K.; Mułenko, W. The Known, the Unknown, and the Expected: 130 Years of Research on Non-Lichenized Fungi and Fungus-Like Organisms in the Białowieża Primeval Forest, Poland. Forests2021, 12, 518. https://doi.org/10.3390/f12050518
     
  • Gancarz, P.J. Hurd and P. Latoch, Polaszek, A.; Michalska-Madej, J.; Grochowalski, Ł.; Strapagiel, D.; Gnat, S.; Załuski, Rusinek, R. Starosta, A.L.; Krutmuang, P.; Martín Hernández, R.; Higes Pascual, M.; Ptaszyńska, A.A.;  Dataset of the next-generation sequencing of variable 16S rRNA from bacteria and ITS2 regions from fungi and plants derived from honeybees kept under anthropogenic landscapes. Data in Brief, 2021, 26(1):107019, doi:10.1016/j.dib.2021.107019
     
  • Ptaszyńska, A.A.; Latoch, P.; Hurd, P.J.; Polaszek, A.; Michalska-Madej, J.; Grochowalski, Ł.; Strapagiel, D.; Gnat, S.; Załuski, D.; Gancarz, M.; Rusinek, R.; Krutmuang, P.; Martín Hernández, R.; Higes Pascual, M.; Starosta, A.L. Amplicon Sequencing of Variable 16S rRNA from Bacteria and ITS2 Regions from Fungi and Plants, Reveals Honeybee Susceptibility to Diseases Results from Their Forage Availability under Anthropogenic Landscapes. Pathogens2021, 10, 381. https://doi.org/10.3390/pathogens10030381
     
  • Kawka, M.; Brzostek, A.; Dzitko, K.; Kryczka, J.; Bednarek, R.; Płocińska, R.; Płociński, P.; Strapagiel, D.; Gatkowska, J.; Dziadek, J.; Dziadek, B. Mycobacterium tuberculosis Binds Human Serum Amyloid A, and the Interaction Modulates the Colonization of Human Macrophages and the Transcriptional Response of the Pathogen. Cells2021, 10, 1264. https://doi.org/10.3390/cells10051264
     
  • Brzostek, A.; Gąsior, F.; Lach, J.; Żukowska, L.; Lechowicz, E.; Korycka-Machała, M.; Strapagiel, D.; Dziadek, J. ATP-Dependent Ligases and AEP Primases Affect the Profile and Frequency of Mutations in Mycobacteria under Oxidative Stress. Genes2021, 12, 547. https://doi.org/10.3390/genes1204054
     
  • Gruszka, R., Zakrzewski, K., Liberski P.P., Zakrzewska, M. mRNA and miRNA Expression Analyses of the MYC/E2F/miR-17-92 Network in the Most Common Pediatric Brain Tumors. International Journal of Molecular Sciences 2021, 22(2):543. doi: 3390/ijms22020543
     
  • Druszczynska, M., Seweryn, M., Wawrocki, S., Kowalewska-Pietrzak, M., Pankowska, A., Rudnicka, W. Cytokine biosignature of active and latent Mycobacterium tuberculosis infections in children. athogens2021 Vol. 10 Iss. 5. doi: 3390/pathogens10050517 
     
  • Brzostek, A., Płociński, P., Minias, A., Ciszewska, A., Gąsior, F., Pawełczyk, J., Dziadek, B., Słomka, M., Dziadek, J. Dissecting the RecA-(In)dependent response to mitomycin C in Mycobacterium tuberculosis using transcriptional profiling and proteomics analyses. Cells2021 Vol. 10 Iss. 5. doi 3390/cells10051168
     
  • Pruszkowska-Przybylska, P., Sitek, A., Rosset, I. , Sobalska-Kwapis, M., Słomka, M., Strapagiel, D., Żądzińska, E. Associations between second to fourth digit ratio, cortisol, vitamin D, and body composition among Polish children. Sci Rep 11, 7029 (2021). doi.org/10.1038/s41598-021-86521-7
     
  • Buda P, Chyb M, Smorczewska-Kiljan A, Wieteska-Klimczak A, Paczesna A, Kowalczyk-Domagała M, Okarska-Napierała M, Sobalska-Kwapis M, Grochowalski Ł, Słomka M, Sitek A, Książyk J and Strapagiel D (2021) Association Between rs12037447, rs146732504, rs151078858, rs55723436, and rs6094136  olymorphisms and Kawasaki Disease in the Population of Polish Children. Front. Pediatr. 9:624798. doi: 10.3389/fped.2021.624798
     
  • Lea M. Schotten, Kaid Darwiche, Michal Seweryn, Vedat Yildiz, Peter J. Kneuertz, Wilfried E.E. Eberhardt, Stephan Eisenmann, Stefan Welter, Brianna E. Sisson, Maciej Pietrzak, Marcel Wiesweg, Till Ploenes, Thomas Hager, Kai He, Lutz Freitag, Clemens Aigner, Christian Taube, Filiz Oezkan,”DNA methylation of PTGER4 in peripheral blood plasma helps to distinguish between lung cancer, benign pulmonary nodules and chronic obstructive pulmonary disease patients”, (2021) European Journal of Cancer,V. 147. Doi: 10.1016/j.ejca.2021.01.032

  • Majak P, Molińska K, Latek M, Rychlik B, Wachulec M, Błauż A, Budniok A, Gruchała M, Lach J, Sobalska-Kwapis M, Baranowska M, Królikowska K, Strapagiel D, Majak J, Chech D, Pałczyński C, Kuna P. Upper-airway dysbiosis related to frequent sweets consumption increases the risk of asthma in children with chronic rhinosinusitis. Pediatr Allergy Immunol. 2020 Nov 22. doi: 10.1111/pai.13417.
     
  • Szczerkowska-Dobosz A, Krasowska D, Bartosińska J, Stawczyk-Macieja M, Walczak A, Owczarczyk-Saczonek A, Reich A, Batycka-Baran A, Czajkowski R, Dobrucki IT, Dobrucki LW, Górecka-Sokołowska M, Janaszak-Jasiecka A, Kalinowski L, Nowicki RJ, Płoska A, Purzycka-Bohdan D, Radulska A, Reszka E, Samotij D, Siekierzycka A, Slominski AT, Slominski RM, Sobalska-Kwapis M, Strapagiel D, Szczęch J, Żmijewski MA, Nedoszytko B. Pathogenesis of psoriasis in the „omic” era. Part IV. Epidemiology, genetics, immunopathogenesis, clinical manifestation and treatment of psoriatic arthritis. Postepy Dermatol Alergol. 2020 Oct;37(5):625-634. doi: 10.5114/ada.2020.100478.
     
  • Nedoszytko, B.; Reszka, E.; Gutowska-Owsiak, D.; Trzeciak, M.; Lange, M.; Jarczak, J.; Niedoszytko, M.; Jablonska, E.; Romantowski, J.; Strapagiel, D.; Skokowski, J.; Siekierzycka, A.; Nowicki, R.J.; Dobrucki, I.T.; Zaryczańska, A.; Kalinowski, L. Genetic and Epigenetic Aspects of Atopic Dermatitis.  J. Mol. Sci.2020, 21, 6484.
     
  • Owczarczyk-Saczonek A, Purzycka-Bohdan D, Nedoszytko B, et al. Pathogenesis of psoriasis in the “omic” era. Part III. Metabolic disorders, metabolomics, nutrigenomics in psoriasis in psoriasis. Advances in Dermatology and Allergology. 2020;37(4):452-467. doi:10.5114/ada.2020.98284.
     
  • Minias, A., Żukowska, L., Lach, J. et al. Subspecies-specific sequence detection for differentiation of Mycobacterium abscessus complex. Sci Rep 10, 16415 (2020). doi.org/10.1038/s41598-020-73607-x
     
  • Grochowalski Ł, Jarczak J, Urbanowicz M, Słomka M, Szargut M, Borówka P, Sobalska-Kwapis M, Marciniak B, Ossowski A, Lorkiewicz W and Strapagiel D (2020) Y-Chromosome Genetic Analysis of Modern Polish Population. Front. Genet. 11:567309. doi: 10.3389/fgene.2020.567309
     
  • Wawrocki S., Seweryn M., Kielnierowski G., Rudnicka W., Druszczynska M. “IL-18 and related function proteins associated with tuberculosis severity and screening for active TB among patients with non-mycobacterial community-acquired pneumonia (CAP)”, Saudi Journal of Biological Sciences, 2020, doi:10.1016/j.sjbs.2020.09.003
     
  • Słomka M., Sobalska-Kwapis M., Korycka-Machała M., Dziadek J., Bartosz G., Strapagiel D. „Comprehensive Analysis of ABCG2 Genetic Variation in the Polish Population and Its Inter-Population Comparison” (2020) Genes, 11 (10), 1144, doi:10.3390/genes11101144
     
  • Samotij D, Nedoszytko B, Bartosińska J, Batycka-Baran A, Czajkowski R, Dobrucki IT, Dobrucki LW, Górecka-Sokołowska M, Janaszak-Jasienicka A, Krasowska D, Kalinowski L, Macieja-Stawczyk M, Nowicki RJ, Owczarczyk-Saczonek A, Płoska A, Purzycka-Bohdan D, Radulska A, Reszka E, Siekierzycka A, Słomiński A, Słomiński R, Sobalska-Kwapis MStrapagiel D, Szczerkowska-Dobosz A, Szczęch J, Żmijewski M, Reich A.. Pathogenesis of psoriasis in the „omic” era. Part I. Epidemiology, clinical manifestation, immunological and neuroendocrine disturbances. Postepy Dermatologii i Alergologii. 2020 Apr;37(2):135-153. DOI: 10.5114/ada.2020.94832.
     
  • Sałkowska, A., Karaś, I., Walczak-Drzewiecka, A.,Krawczyk, M., Sobalska-Kwapis, M., Dastych, J., Ratajewski M. Identification of Novel Molecular Markers of Human Th17 Cells (2020) Cells, 9, 1611; org/10.3390/cells9071611
     
  • Nedoszytko, B.; Sobalska-Kwapis, M.; Strapagiel, D.; Lange, M.; Górska, A.; Elberink, J.N.G.O.; van Doormaal, J.; Słomka, M.; Kalinowski, L.; Gruchała-Niedoszytko, M.; Nowicki, R.J.; Valent, P.; Niedoszytko, M. Results from a Genome-Wide Association Study (GWAS) in Mastocytosis Reveal New Gene Polymorphisms Associated with WHO Subgroups.  J. Mol. Sci.2020, 21, 5506.DOI: 10.3390/ijms21155506
     
  • Nedoszytko, B., Szczerkowska-Dobosz, A., Stawczyk-Macieja, M., Owczarczyk-Saczonek, A., Reich A., Bartosińska J., Batycka-Baran, A., Czajkowski R., Dobrucki I. T., Dobrucki L. W., Górecka-Sokołowska M., Janaszak-Jasiecka A., Kalinowski L., Krasowska D., Purzycka-Bohdan D., Radulska A., Reszka E., Samotij D., Sobalska-Kwapis M., Słominski A., Słominski R., Strapagiel D., Szczęch J., Żmijewski M., Nowicki R. J. Pathogenesis of psoriasis in the “omic” era. Part II. Genetic, genomic and epigenetic changes in psoriasis (2020) Advances in Dermatology and Allergology 3/2020 vol. 37, org/10.5114/ada.2020.96243
     
  • Bialik P., Wysokinski D., Slomka M., Morawiec Z., Strapagiel D., Wozniak K. HRM screening of the UBC9 gene encoding the SUMO-E2-conjugating enzyme — case-control study in breast cancer (2020) Exp Oncol 2020 42, 2, DOI:32471/exp-oncology.2312-8852.vol-42-no-2.14739
     
  • Korycka-Machała, M.; Pawełczyk, J.; Borówka, P.; Dziadek, B.; Brzostek, A.; Kawka, M.; Bekier, A.; Rykowski, S.; Olejniczak, A.B.; Strapagiel, D.; Witczak, Z.; Dziadek, J. PPE51 Is Involved in the Uptake of Disaccharides by Mycobacterium tuberculosis. Cells2020, 9, 603. doi.org/10.3390/cells9030603
     
  • Pruszkowska‐Przybylska, P., Sitek, A., Rosset, I., Sobalska‐Kwapis, M., Słomka, M., Strapagiel, D., Żądzińska, E., Morling, N. “Association of saliva 25(OH)D concentration with body composition and proportion among pre‐pubertal and pubertal Polish children” (2020) American Journal of Human Biology, 23 Janurary 2020 doi.org/10.1002/ajhb.23397
     
  • Jagielski, T., Borówka, P.,Bakuła, Z., Lach, J., Marciniak, B., Brzostek,A., Dziadek, J., Dziurzyński, M., Pennings, L., van Ingen,J., Žolnir-Dovč, Z., Strapagiel, D. „Genomic Insights Into the Mycobacterium kansasii Complex: An Update” (2020) Front. Microbiol., 15 January 2020 doi.org/10.3389/fmicb.2019.02918

  • Jarczak, J., Lach, J., Borówka, P., Gałka, M., Bućko, M., Marciniak, B., Strapagiel, D.. „BioSCOOP – Biobank Sample Communication Protocol. New approach for the transfer of information between biobanks” (2019) Database (Oxford) 2019  Jan 1 doi.org/10.1093/database/baz105

  • Zawilak-Pawlik, A., Zarzecka, U., Żyła-Uklejewicz, D., Lach, J., Strapagiel, D., Tegtmeyer, N., Böhm, M., Backert, S., Skorko-Glonek, J.. “Establishment of serine protease htrA mutants in Helicobacter pylori is associated with secA mutations” (2019) Science Report 2019 Aug 13;9(1) doi: 10.1038/s41598-019-48030-6

  • Korycka-Machała, M., Viljoen, A., Pawełczyk, J., Borówka, P., Dziadek, B., Gobis, K., Brzostek, A., Kawka, M., I., Blaise, M., Strapagiel,  , Kremer, L., Dziadek, J. „1H-benzo[d]imidazole derivatives affect MmpL3 in Mycobacterium tuberculosis”  (2019) Antimicrob Agents Chemother 2019 Jul 22 doi.org/10.1128/AAC.00441-19

  • Borówka, P., Pułaski, Ł., Marciniak, B., Borowska-Strugińska, B., Dziadek, J., Żądzińska, E., Lorkiewicz, W., Strapagiel, D. “Screening methods for detection of ancient Mycobacterium tuberculosis complex fingerprints in next-generation sequencing data derived from skeletal samples” (2019) GigaScience 2019 Jun 1; 8(6) doi.org/10.1093/gigascience/giz065

  • Brodzik, K., Krysztopa-Grzybowska, K., Polak, M., Lach, J., Strapagiel, D., Zasada, A.A.” Analysis of the Amino Acid Sequence Variation of the 67–72p Protein and the Structural Pili Proteins of Corynebacterium diphtheriae for their Suitability as Potential Vaccine Antigens” (2019) Polish Journal of Microbiology vol. 68(2) doi:10.33073/pjm-2019-025

  • Dobrowolska, S., Michalska-Madej, J., Słomka, M., Sobalska-Kwapis, M., Strapagiel, D. „Biobank Łódź® – population based biobank at the University of Łódź, Poland” (2019) European Journal of Translational and Clinical Medicine 2019 (vol. 2), No. 1: 85-95 doi.org/10.33073/pjm-2019-025

  • Karwaciak I, Sałkowska A, Karaś K, Sobalska-Kwapis M, Walczak-Drzewiecka A, Pułaski Ł, Strapagiel D, Dastych J, Ratajewski M. „SIRT2 Contributes to the Resistance of Melanoma Cells to the Multikinase Inhibitor Dasatinib” (2019) Cancers (Basel). 2019 May 14;11(5) doi: 10.3390/cancers11050673.

  • Lorkiewicz, W., Mietlińska, J., Karkus, J., Kurek, M., Borówka, P., Stuss, M., Sewerynek, E., Plażuk, D., Żądzińska, E. „Osteoporotic bone fractures and age-related bone loss in males inhabiting the Kujawy region in north-central Poland from the Neolithic to early modern times” (2019) Journal of Archaeological Science, Volume 103, 16-25 doi.org/10.1016/j.jas.2019.01.005

  • Pruszkowska-Przybylska P, Sitek A, Rosset I, Żądzińska E, Sobalska-Kwapis M, Słomka M, Strapagiel D. „The association between socioeconomic status, duration of breastfeeding, parental age and birth parameters with BMI, body fat and muscle mass among prepubertal children in Poland. (2019) Anthropol Anz. 2019 Feb 28. DOI: 10.1127/anthranz/2019/0955

  • Płociński, P., Macios, M., Houghton, J., Niemiec, , Płocińska, R., Brzostek, A., Słomka, M.,  Dziadek, J., Young, D., Dziembowski, A. „Proteomic and transcriptomic experiments reveal an essential role of RNA degradosome complexes in shaping the transcriptome of Mycobacterium tuberculosis”,  (2019) Nucleic Acids Research, https://doi.org/10.1093/nar/gkz251

  • Jarczak, J., Grochowalski, Ł., Marciniak, B., Lach, J., Słomka, M., Sobalska-Kwapis, M., Lorkiewicz, W., Pułaski, Ł., Strapagiel, D. „Mitochondrial DNA variability of the Polish population”. European Journal of Human Genetics (2019) doi.org/10.1038/s41431-019-0381-x

  • Reczyńska D, Witek B, Jarczak J, Czopowicz M, Mickiewicz M, Kaba J, Zwierzchowski L and Bagnicka E. “The impact of organic vs. inorganic selenium on dairy goat productivity and expression of selected genes in milk somatic cells.” Journal of Dairy Research Volume 86, Issue 1February 2019 , pp. 48-54 doi.org/10.1017/S0022029919000037

  • Karaś K, Sałkowska A, Sobalska-Kwapis M, Walczak-Drzewiecka A, Strapagiel D, Dastych J, Bachorz RA, Ratajewski M. „Digoxin, an Overlooked Agonist of RORγ/RORγT”. Front Pharmacol. 2019 Jan 7;9:1460. doi.org/10.3389/fphar.2018.01460

  • Pułaski, Ł., I. Jatczak-Pawlik, Sobalska-Kwapis, D. Strapagiel, G. Bartosz, I.Sadowska-Bartosz. „3-Bromopyruvate induces expression of antioxidant genes”. Free Radical Biology and Medicine 120:S111; doi.org/10.1016/j.freeradbiomed.2018.04.367

  • Fernandes, D. M., Strapagiel, D., Borówka, P., Marciniak, B., Żądzińska, E., Sirak, K., Siska, V., Grygiel, R., Carlsson, J., Manica, A., Lorkiewicz, PinhasiR. “A genomic Neolithic time transect of hunter-farmer admixture in central Poland”. Scientific Reports (2018) 8:14879. DOI:10.1038/s41598-018-33067-w
     
  • Antczak M, Płocińska R, Płociński P, Rumijowska-Galewicz A, Żaczek A, Strapagiel D, Dziadek J. „The NnaR orphan response regulator is essential for the utilization of nitrate and nitrite as sole nitrogen sources in mycobacteria”. Sci Rep. 2018 Dec 3;8(1):17552. doi: 10.1038/s41598-018-35844-z.
     
  • Lewczuk P, Gaignaux A, Kofanova O, Ermann N, Betsou F, Brandner S, Mroczko B, Blennow K, Strapagiel D, Paciotti S, Vogelgsang J, Roehrl MH, Mendoza S, Kornhuber J, Teunissen C. „Interlaboratory proficiency processing scheme in CSF aliquoting: implementation and assessment based on biomarkers of Alzheimer’s disease”. (2018) Alzheimers Res Ther. 2018 Aug 28;10(1):87. doi: 10.1186/s13195-018-0418-3.
     
  • Pruszkowska-Przybylska, P., A. Sitek, I. Rosset, M. Sobalska-KwapisM. SłomkaD. Strapagiel, E. Żądzińska. „Association of the 2D:4D digit ratio with body composition among the Polish children aged 6–13 years”. Early Human Development, 124(2018). doi.org/10.1016/j.earlhumdev.2018.08.001
     
  • Kukla-Bartoszek, M., E. Pośpiech, M. Spólnicka, J. Karłowska-Pik, D. Strapagiel, E. Żądzińska, I. Rosset, M. Sobalska-KwapisM. Słomka, S. Walsh, M. Kayser, A. Sitek, W. Branicki. “Investigating the impact of age-depended hair colour darkening during childhood on DNA-based hair colour prediction with the HIrisPlex system”. Forensic Science International: Genetics 36 (2018) 26-33. doi.org/10.1016/j.fsigen.2018.06.007
     
  • Kozera, Ł., D. Strapagiel, J. Gleńska-Olender, A. Chrościcka, K. Ferdyn, J. Skokowski, L. Kalinowski,  J. Pawlikowski, B. Marciniak,  M. Pasterk, A. Matera-Witkiewicz, M. Lewandowska-Szumiel,  M. Piast,  M. Witoń. „Biobankowanie ludzkiego materiału biologicznego dla celów naukowych w Polsce i Europie”. Studia Iuridica LXXII, 2018, T.73, wyd. WUW. doi: 10.5604/01.3001.0012.1357
     
  • Marciniak, B., P. Topolski, D. Strapagiel. „Anonimizacja w dobie wielkich danych – sytuacja biobanków w kontekście RODO”. Studia Iuridica LXXII, 2018, T.73, wyd. WUW. doi: 10.5604/01.3001.0012.1365
     
  • Pułaski, Ł., I. Jatczak-Pawlik, M. Sobalska-Kwapis, D. Strapagiel, G. Bartosz, I.Sadowska-Bartosz. „3-Bromopyruvate induces expression of antioxidant genes”. Free Radical Biology and Medicine 120:S111; doi.org/10.1016/j.freeradbiomed.2018.04.367
     
  • Bakuła Z., A. Brzostek, P. Borówka, A. Żaczek. I. Szulc-Kielbik, A. Podpora, P. Parniewski, D. Strapagiel, J. Dziadek, M. Proboszcz, J. Bielecki, J. van Ingen, T. Jagielski. „Molecular typing of Mycobacterium kansasii using pulsed-field gel electrophoresis and a newly designed variable-nuber tandem repeat analysis.” Scientific Reports. 2018; doi:10.1038/s41598-018-21562-z
     
  • Holub P., F. Kohlmayer, F. Prasser, M.T. Mayrhofer, I. Schlunder, G.M. Martin, S. Casati, L. Koumakis, A. Wutte, L. Kozera, D. Strapagiel, G. Anton, G. Zanetti, O.U. Sezerman, M. Mendy, D. Valik, M. Lavitrano, G. Dagher, K. Zatloukal, GJ. B. van Ommen, J-E. Litton (2018). „Enhancing Reuse of Data and Biological Material in Medical Research: From FAIR to FAIR-Health.” Biopreservation and Biobanking. 2018; doi:10.1089/bio.0110

  • Słomka, M., Sobalska-Kwapis, M. Wachulec, G. Bartosz, D. Strapagiel. „High Resolution Melting (HRM) for High-Throughput Genotyping—Limitations and Caveats in Practical Case Studies”. International Journal of Molecular Sciences 15(11), 2017; doi:10.3390/ijms18112316
     
  • Labudda, Ł., Strapagiel, J. Karczewska-Golec, P. Golec. „Complete Annotated Genome Sequences of Four Klebsiella pneumoniae Phages Isolated from Sewage in Poland”. Genome Announcements 5(45), 2017; doi:10.1128/genomeA.00919-17
     
  • Kołsut J, BorówkaB. Marciniak, E. Wójcik, A. Wojtasik, D. Strapagiel, J. Dastych. In silico Analysis of Virulence Associated Genes in Genomes of Escherichia Coli Strains Causing Colibacillosis in Poultry. Journal of Veterinary Research, 61(4), 2017; doi:10.1515/jvetres-2017-0051
     
  • Nedoszytko B., A. Siemińska, D. Strapagiel, S. Dąbrowski, M. Słomka, M. Sobalska-Kwapis, B. Marciniak, J. Wierzba, J. Skokowski, M. Fijałkowski, R. Nowicki, L. Kalinowski (2017). „High prevalence of carriers of variant c.1528G>C of HADHAgene causing long-chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase deficiency (LCHADD) in the population of adult Kashubians from North Poland” PLoS ONE 12(11): e0187365. 
     
  • Sobalska-Kwapis M., B. Smolarz, M. Słomka, T. Szaflik, E. Kępka, B. Kulig, A. Siewierska-Górska, G. Polak, H. Romanowicz, D. Strapagiel , K. Szyłło (2017). „New variants near RHOJ and C2, HLA-DRA region and susceptibility to endometriosis in the Polish population − the genome-wide association study” EJOG doi.org/10.1016/j.ejogrb.2017.08.037
     
  • Sobalska-Kwapis M., A. Suchanecka, M. Słomka, A. Siewierska-Górska, E. Kępka, D. Strapagiel (2017). „Genetic association of FTO/IRX region with obesity and overweight in the Polish population.” PLoS ONE 12(6): e0180295
     
  • Borówka P., J. Lach, Z. Bakuła, J. van Ingen, A. Safianowska, A. Brzostek, J. Dziadek, D. Strapagiel, T. Jagielski (2017). „Draft Genome Sequences of Mycobacterium kansasii Clinical Strains.” Genome Announc. June 2017 vol. 5 no. 22 e00406-17
     
  • Ratajewski M., M. Słomka, K. Karaś, M. Sobalska-Kwapis, M. Korycka-Machała, A. Sałkowska, J. Dziadek, D. Strapagiel, J. Dastych (2017). „Functional Analysis of the rs774872314, rs116171003, rs200231898 and rs201107751 Polymorphisms in the Human RORγT Gene Promoter Region.” Genes 2017, doi:10.3390/genes8040126
     
  • Witoń M., D. Strapagiel, J. Gleńska-Olender, A. Chróścicka, K. Ferdyn, J. Skokowski, L. Kalinowski, J. Pawlikowski, B. Marciniak, M. Pasterk, A. Matera-Witkiewicz, Ł. Kozera (2017). „Organisation of BBMRI.pl: The Polish Biobanking Network”. Biopreservation and Biobanking 2017, doi:10.1089/bio.2016.0091
     
  • Siewierska-Górska A., A. Sitek, E. Żądzińska, G. Bartosz, D. Strapagiel (2017). „Association of five SNPs with human hair colour in the Polish population.” Homo 2017; http://dx.doi.org/10.1016/j.jchb.2017.02.002
     
  • Rosset I., E. Żądzińska, D. Strapagiel, A. Grzelak, M. Henneberg (2017). „Association between body height and month of birth among women of European origin in northern and southern hemispheres.” Am J Hum Biol. 2017;00:e22967. doi:10.1002/ajhb.22967

  • Romanowicz H., D. Strapagiel, M. Słomka, M. Sobalska-Kwapis, E. Kępka, A. Siewierska-Górska, M. Zadrożny, J. Bieńkiewicz, B. Smolarz (2016). „New single nucleotide polymorphisms (SNPs) in homologous recombination repair genes detected by microarray analysis in Polish breast cancer patients.” Clin Exp Med (2016). doi:10.1007/s10238-016-0441-2
     
  • Strapagiel D., M. Słomka, M. Sobalska-Kwapis, B. Marciniak (2016). „Biobank Lodz – DNA Based Biobank at the University of Lodz, Poland.” Open J Bioresources, 3(1), p.e6
     
  • Sitek A., I. Rosset, E. Żądzińska, A. Siewierska-Górska, E. Pietrowska, D. Strapagiel (2016). „Selected gene polymorphisms effect on skin and hair pigmentation in Polish children at the prepubertal age.” Anthropologischer Anzeiger, 73 (4): 283-293.
     
  • Karczewska – Golec J., D. Strapagiel, M. Sadowska, A. Szalewska – Pałasz, P. Golec (2016). „Draft Genome Sequence of Shewanella baltica M1 Isolated from Brackish Surface Water of the Gulf of Gdańsk.” Genome Announcements 4(3):e00611-16.
     
  • Strapagiel D., P. Borówka, Z. Bakuła, B. Marciniak,  J. van Ingen, A. Safianowska, A. Brzostek, J. Dziadek, T. Jagielski (2016). „Draft Genome Sequences of Mycobacterium kansasii Strains 1010001454, 1010001458, 1010001468, 1010001493, 1010001495, and 1010001469, Isolated from Environmental Sources.” Genome Announcements 4(3):e00456-16.
     
  • Caban M., D. Strapagiel, J. Dziadek, M. Korycka-Machala, A. Grzelak (2016). „Principles of a New Protocol for Prediction of Azole Resistance in Candida albicans Infections on the Basis of ERG11 Polymorphisms.” Current Microbiology 2016.
     
  • Rosset I., D. Strapagiel, A. Sitek, M. Majewska, L. Ostrowska-Nawarycz, E. Żądzińska (2016). „Association of FTO and TMEM18 polymorphisms with overweight and obesity in the population of Polish children.” Anthropological Review 79(1): 17-33.
     
  • Matusiak A., M. Chałubiński, M. Broncel, T. Rechciński, K. Rudnicka, E. Miszczyk, M. Walencka, D. Strapagiel, A. Gajewski, M. Chmiela (2016). „Putative consequences of exposure to Helicobacter pylori infection in patients with coronary heart disease in terms of humoral immune response and inflammation.” Arch Med Sci 1 (12).

  • Słomka M, Sobalska-Kwapis M, Korycka-Machała M, Bartosz G, Dziadek J, Strapagiel D. Genetic variation of the ABC transporter gene ABCC1 (Multidrug resistance protein 1-MRP1) in the Polish population. BMC Genet. 2015 Sep 23;16:114. doi: 10.1186/s12863-015-0271-3

KOLEKCJE

W Pracowni Biobank zdeponowane są kolekcje materiału biologicznego, w tym jedyny i reprezentatywny zbiór próbek ok. 11 tysięcy dobrowolnych dawców z terenu całego kraju (kolekcja POPULOUS). Zdeponowane są także kolekcje próbek klinicznych, w tym chorych na raka piersi (BREAST), chorych na raka trzustki (PANC), ale też reprezentatywna kolekcja próbek z populacji dzieci w wieku szkolnym z terenu miasta Łodzi (PUPILS).

W ostatnich latach zebrano kolekcję próbek od mniejszości narodowych zamieszkujących Polskę (MNIEJSZOSCI) oraz próbki mieszkańców województwa łódzkiego (PRAMATKA) i (BBMRI). Celem zbierania próbek materiału biologicznego jest, poprzez rozwój nauki, udostępnianie zbiorów innym jednostkom badawczym w ramach współpracy.

POPUlation – LOdz’s UniverSity Biobank” - zbiór populacyjny, odpowiedni do wielu badań typu „case-control”, zawiera ok. 11 tysięcy ochotników reprezentujących strukturę ludności naszego kraju na 2010 rok, zbiór zanonimizowany, dołączona rozbudowana ankieta (dane antropometryczne, fenotypowe, stan zdrowotny).

Materiał biologiczny - ślina, DNA
Dysponent - Katedra Biofizyki Molekularnej UŁ

„breast cancer patients” - ok. 1000 pacjentek rekrutowanych dzięki współpracy z Instytutem Centrum Zdrowia Matki Polki w Łodzi, wszystkie pacjentki poddawano terapii adiuwantowej, około 200 z nich poddawana również terapii neoadiuwantowej. Pacjentki głównie z regionu województwa łódzkiego, zgromadzone dane zawierają informacje na temat diagnozy, podjętego leczenia i jego efektów. Grupa o charakterze retrospektywnym, zbiór anonimowy (dane identyfikujące jedynie w posiadaniu ICZMP w Łodzi).

Materiał biologiczny - tkanki zatopione w bloczkach parafinowych (skrawki), DNA
Dysponent - Katedra Biofizyki Molekularnej UŁ

„pancreatic cancer patients” - ok. 200 pacjentów rekrutowanych dzięki współpracy z Uniwersytetem Medycznym w Łodzi, wszystkich pacjentów poddawano chemioterapii. Pacjenci głównie z regionu województwa łódzkiego, dane na temat diagnozy, podjętego leczenia i jego efektów. Grupa o charakterze prospektywnym, zbiór anonimowy (dane identyfikujące jedynie w posiadaniu UM w Łodzi).

Materiał biologiczny - ślina, DNA
Dysponent - Katedra Biofizyki Molekularnej UŁ

„children's obesity focused collection” - ok. 500 dzieci, rekrutowanych dzięki zgodzie rodziców/opiekunów prawnych. Dzieci uczęszczające do łódzkich szkół, które podjęły współpracę. Rozbudowany pakiet danych socjoekonomicznych oraz antropometrycznych. Zbiór anonimowy (dane identyfikujące jedynie w posiadaniu Katedry Antropologii UŁ).

Materiał biologiczny - ślina, DNA
Dysponent - Katedra Antropologii UŁ.

zbiór populacyjny grupy ochotników deklarujących przynależność do mniejszości narodowych w Polsce, zbiór zanonimizowany, dołączona rozbudowana ankieta (dane antropometryczne, fenotypowe, stan zdrowotny).

Materiał biologiczny - ślina, DNA
Dysponent - Pracownia Biobank UŁ

zbiór populacyjny, zbiór zanonimizowany, dołączona rozbudowana ankieta (dane antropometryczne, fenotypowe, stan zdrowotny).

Materiał biologiczny - ślina, DNA
Dysponent - Pracownia Biobank UŁ

zbiór populacyjny grupy ochotników w przedziale wiekowym 18-50 lat, zdrowych, zawiera 640 ochotników reprezentujących strukturę mieszkańców Łodzi, zbiór zanonimizowany, dołączona ankieta (dane antropometryczne, stan zdrowotny, historia rodzinna chorób).

Materiał biologiczny - surowica, osocze, kożuszek leukocytarno-płytkowy
Dysponent - Pracownia Biobank UŁ

DOSTĘP DO KATALOGÓW